Cụ thể, các cơ sở khám chữa bệnh phải lưu phim chẩn đoán hình ảnh, trừ trường hợp khám, điều trị ngoại trú. Trường hợp chuyển tuyến, cần chuyển các phim chẩn đoán hình ảnh kèm theo các giấy, phiếu chuyển viện (thay vì chỉ giấy chuyển viện như trước).
Các cơ sở khám chữa bệnh phải thực hiện theo các tài liệu chuyên môn hướng dẫn về chẩn đoán, điều trị và quy trình kỹ thuật do Bộ Y tế hoặc người đứng đầu cơ sở ban hành. Với các dịch vụ khám chữa bệnh chưa được Bộ Y tế ban hành hướng dẫn, người đứng đầu cơ sở khám chữa bệnh xây dựng và phải gửi một bản đến cơ quan BHXH tỉnh.
Thông tư cũng sửa đổi nguyên tắc thanh toán dịch vụ kỹ thuật đặt stent động mạch vành phải sử dụng nhiều hơn một stent phủ thuốc trong Thông tư 04/2017. Thông tư 50 cũng hướng dẫn chi tiết mức thanh toán theo từng mức hưởng của các nhóm đối tượng và trường hợp đi khám chữa bệnh đúng tuyến, trái tuyến...
Theo đó, mức thanh toán cho tổng chi phí vật tư y tế bao gồm stent thứ nhất và tổng vật tư y tế khác ngoài stent trong một lần sử dụng dịch vụ kỹ thuật. Ngoài ra, Quỹ BHYT thanh toán thêm 50% chi phí với stent thứ hai theo giá mua vào của cơ sở khám chữa bệnh, nhưng không cao hơn 18 triệu đồng... Thông tư có hiệu lực thi hành kể từ ngày 1/3/2018.
