Dự án Xây dựng nút giao thông Mỹ Thủy có thiết kế hoàn chỉnh với quy mô nút giao 3 tầng. Các hạng mục chính của dự án gồm có cầu vượt qua nút giao theo hướng đường Võ Chí Công đáp ứng 8 làn xe ôtô; xây dựng cầu vượt rẽ trái hướng Cát Lái đi cầu Phú Mỹ đáp ứng 2 làn xe ôtô; xây dựng hầm chui rẽ trái hướng từ đường Võ Chí Công đi Cát Lái đáp ứng 2 làn xe ôtô;

Dự án còn xây dựng cầu Kỳ Hà 3 đáp ứng 8 làn xe ôtô; xây dựng cầu Kỳ Hà 4 hướng Võ Chí Công rẽ phải về Cát Lái đáp ứng 3 làn xe; xây dựng các nhánh đường dưới dạ cầu để phân tách và đảm bảo an toàn cho xe 2 bánh lưu thông.

Ngoài ra dự án cũng thực hiện hệ thống cây xanh, chiếu sáng đồng bộ trong toàn nút giao.

Các hạng mục của dự án nút giao Mỹ Thủy được phân kỳ đầu tư thành 3 giai đoạn.

Đến thời điểm hiện tại, Ban Giao thông TPHCM đã hoàn thành một số hạng mục thuộc giai đoạn 1 và giai đoạn 2 của dự án, đưa vào khai thác sử dụng từ đầu năm 2019 đến năm 2021 như: hầm chui rẽ trái, một đơn nguyên cầu vượt 4 làn xe trên đường Vành đai 2 và cầu Kỳ Hà 3 – nhánh trái, cầu Mỹ Thủy 3 gồm 6 làn xe nằm giữa cầu Mỹ Thủy 1 và cầu Mỹ Thủy 2.

Từ cuối năm 2023 đến nay, Ban Giao thông TPHCM đang tiếp tục khẩn trương triển khai thi công một số hạng mục được bàn giao mặt bằng gồm cầu vượt rẽ trái từ Cát Lái đi Phú Mỹ, cầu Kỳ Hà 4. Đối với giai đoạn 3 của dự án (dự kiến khởi công vào ngày 14/3) sẽ gồm hạng mục cầu vượt trên đường Vành đai 2 – nhánh phải và Cầu Kỳ Hà 3 – nhánh phải gồm 4 làn xe.