Tiền thân là CLB Hà Nội đang chơi tại Toyota V-League 2016, sau khi các cổ đông của công ty cổ phần phát triển bóng đá Sài Gòn ra quyết nghị đổi tên CLB, chuyển vào TP.Hồ Chí Minh hoạt động và thi đấu nhằm mục tiêu phát triển lâu dài, CLB bóng đá Sài Gòn đã hoàn tất những thủ tục pháp lý và được LĐBĐ Việt Nam, công ty cổ phần bóng đá chuyên nghiệp Việt Nam công nhận.
Tại vòng 5 Toyota V-League 2016, đội bóng của HLV Nguyễn Đức Thắng đã đá trận đầu tiên dưới cái tên CLB bóng đá Sài Gòn.
Sau khi trở thành thành viên chính thức của LĐBĐ TP.HCM, CLB bóng đá Sài Gòn đặt mục tiêu phát triển bền vững và lâu dài, trở thành đại diện ưu tú của bóng đá thành phố. Trước mắt, trong chiến lược phát triển, công ty cổ phần phát triển bóng đá Sài Gòn- CLB bóng đá Sài Gòn nâng vốn điều lệ từ 25 tỷ đồng lên 100 tỷ đồng.
Mục tiêu của công ty là hoạt động theo mô hình công ty cổ phần đại chúng, tham gia vào các hoạt động sản xuất và kinh doanh. Hiện đã có nhiều doanh nghiệp lớn quyết định đồng hành, tham gia góp vốn và trở thành cổ đông lớn của công ty như tập đoàn Trường Hải, Him Lam, Trung Nam, Phương Trang, SHS, Chiến Thắng…
Phát biểu trong lễ ra mắt CLB bóng đá Sài Gòn, ông Nguyễn Giang Đông- Chủ tịch CLB bóng đá Sài Gòn cho biết: “CLB bóng đá Sài Gòn rất hãnh diện khi trở thành thành viên chính thức LĐBĐ TP.HCM. Với tư cách là đại diện bóng đá Sài thành thi đấu ở giải đấu cao nhất của bóng đá Việt Nam, CLB bóng đá Sài Gòn cam kết nỗ lực, thi đấu hết mình, đem lại thành công cho bóng đá thành phố. Đội bóng còn có trách nhiệm đá đẹp, cống hiến, tinh thần fair-play để khơi dậy niềm tự hào về bóng đá thành phố”.
Chủ tịch LĐBĐ TPHCM (HFF) Trần Anh Tú chúc mừng đội bóng mới. Theo ông Trần Anh Tú, sự có mặt của CLB bóng đá Sài Gòn giúp Tp Hồ Chí Minh có 2 đội tranh tài ở các giải đấu đỉnh cao là 1 tín hiệu tốt. "Tôi tin rằng CLB bóng đá Sài Gòn sẽ bám chặt và có định hướng phát triển nghiêm túc, lâu dài"-ông Trần Anh Tú cho biết.
Nhân dịp ra mắt, CLB bóng đá Sài Gòn đã trao tặng HFF 2 tỷ đồng. Chiều nay, đội bóng của HLV Nguyễn Đức Thắng sẽ có trận đấu đầu tiên trên sân Thống Nhất với QNK Quảng Nam.
CLB sẽ mở cửa miễn phí và tổ chức nhiều chương trình ca múa nhạc để phục vụ người hâm mộ.
