Sáng sớm 21/5/1993, thi thể bà Dương Thị Mỹ được phát hiện tại một vườn điều ở thôn 2, xã Tân Minh (nay là thị trấn Tân Minh, Hàm Tân, Bình Thuận). Xác định bà Mỹ bị giết đêm 18 rạng ngày 19/5/1993, Cơ quan CSĐT quyết định khởi tố vụ án.
Từ ngày 27/5/1993 đến ngày 26/7/1993, vợ chồng bà Nguyễn Thị Nhung, chị ruột vợ ông Huỳnh Văn Nén, bị tạm giữ tại Công an huyện Hàm Tân. Ngày 22/9/1993, Công an Bình Thuận đình chỉ điều tra vụ án.
Đêm 23/4/1998, bà Lê Thị Bông cũng ở thôn 2 bị giết tại nhà. Ngày 17/5/1998, ông Nén bị bắt vì bị coi là thủ phạm giết bà Bông. Trong tù, ông Nén nhận tội giết bà Bông để cướp chiếc nhẫn 1 chỉ vàng, rồi khai đã cùng nhiều người của gia đình vợ giết bà Dương Thị Mỹ.
Từ lời khai này, ngày 2/12/1998, Công an tỉnh Bình Thuận phục hồi điều tra vụ bà Mỹ bị giết, khởi tố Huỳnh Văn Nén và 9 người khác, gồm cả vợ và mẹ vợ ông này. Vụ án đó sau này nổi tiếng với tên gọi “vụ án vườn điều”.
Ngày 26/8/2000, một phạm nhân tại Trại giam Sông Cái (Ninh Thuận) tên là Nguyễn Phúc Thành tố cáo Nguyễn Thọ và Hồ Văn Việt cùng ở xã Tân Minh là thủ phạm giết bà Bông.
Tuy nhiên, ngày 31/8/2000, xét xử sơ thẩm vụ án bà Bông, TAND tỉnh Bình Thuận vẫn nhận định, bị cáo Huỳnh Văn Nén là thủ phạm giết bà Bông.
Do bị cáo Nén đã có công khai báo về “vụ án vườn điều”, nên tòa cho bị cáo được hưởng tình tiết giảm nhẹ, tuyên phạt tù chung thân về tội giết người.
Ngày 23/10/2000, ông Nén làm đơn kháng cáo, xin giảm nhẹ hình phạt, nhưng không được Tòa Phúc thẩm, TAND Tối cao tại TPHCM chấp nhận. Bản án hình sự sơ thẩm số 96/HSST ngày 31/8/2000 của TAND tỉnh Bình Thuận có hiệu lực thi hành.
Ngày 7/3/2001, TAND tỉnh Bình Thuận xét xử sơ thẩm (lần 1) “vụ án vườn điều”, tuyên án phạt tù giam từ 2 năm đến 10 năm về tội “giết người” đối với 5 bị cáo, trong đó Huỳnh Văn Nén bị phạt 6 năm tù.
Ngày 14/6/2001, tại phiên tòa phúc thẩm (lần 1) “vụ án vườn điều”, ông Nén phản cung, nói rằng những lời bị cáo nhận tội và khai báo về hành vi phạm tội của những người khác là do bị đánh, bị bức cung, thực tế bị cáo hoàn toàn không biết gì về vụ bà Mỹ bị giết…
Từ ngày 9 đến 11/3/2005, Tòa Phúc thẩm, TAND Tối cao tại TPHCM xét xử phúc thẩm (lần 2) “vụ án vườn điều”, tuyên hủy toàn bộ bản án sơ thẩm (lần 2), giao toàn bộ hồ sơ cho cấp sơ thẩm điều tra lại từ đầu, kiến nghị Cơ quan điều tra Bộ Công an thụ lý điều tra.
Ngày 26/12/2005, Cơ quan CSĐT Bộ Công an ra các quyết định đình chỉ điều tra đối với các bị can trong “vụ án vườn điều”, do không đủ chứng cứ chứng minh hành vi phạm tội của họ. Sau đó, các bị cáo trong vụ án này được đình chỉ điều tra, được trả tự do, được các cơ quan pháp luật tỉnh Bình Thuận xin lỗi công khai và được bồi thường oan sai. Riêng ông Nén không được bồi thường oan sai trong “vụ án vườn điều”, tiếp tục thụ án tù chung thân tại vụ án bà Bông.
Nhận thấy có nhiều thiếu sót, vi phạm nghiêm trọng trong mọi khâu của quá trình điều tra, xét xử vụ án Huỳnh Văn Nén, ngày 12/11/2014, TAND Tối cao có quyết định giám đốc thẩm, hủy phần tội danh và hình phạt đối với ông Huỳnh Văn Nén của bản án hình sự sơ thẩm ngày 31/8/2000 của TAND tỉnh Bình Thuận, giao hồ sơ về cấp sơ thẩm để điều tra lại.
Ngày 6/1/2015, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Bình Thuận tiếp nhận hồ sơ vụ án để điều tra lại, ra lệnh tạm giam 4 tháng đối với bị can Huỳnh Văn Nén. Sau đó, Viện KSND tỉnh Bình Thuận đã hai lần gia hạn tạm giam ông Nén, đến ngày 8/1/2016. Ngày 22/10, ông Nén được tại ngoại để chữa bệnh.
Theo các luật sư tham gia bào chữa miễn phí cho ông Nén, trong thời gian điều tra lại 10 tháng qua, cơ quan điều tra không tìm được bằng chứng nào kết tội bị can Huỳnh Văn Nén. Do vậy, họ sẽ làm đơn yêu cầu đình chỉ điều tra vụ án và trả tự do cho ông Nén. Có khả năng, vụ án Huỳnh Văn Nén sẽ khép lại giống “vụ án vườn điều”.
