Trong quá trình điều tra, Mai Thanh Hải đã thành khẩn khai báo, hợp tác với cơ quan điều tra làm rõ hành vi phạm tội của đường dây tham nhũng này và đã trả lại toàn bộ số tiền chiếm đoạt để khắc phục hậu quả. Vì vậy, Cơ quan điều tra đã xem xét cho phép Hải được tại ngoại.
Trước đó, Cơ quan an ninh điều tra (Bộ Công an) đã kết thúc điều tra và chuyển hồ sơ sang VKSND Tối cao đề nghị truy tố Mai Thanh Hải về tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản” và “Làm giả tài liệu của cơ quan, tổ chức”.
Dựa vào thế lực của bố, Hải đã nhận của Đặng Vũ Quang (nguyên Phó giám đốc Công ty TNHH Hàng Đầu, Hà Nội) 560 triệu đồng để “chạy” quota hàng dệt may vào thị trường Mỹ cho Công ty Qualitex. Khi sự việc đổ bể, Hải đã giao cho Quang 664 triệu đồng (thừa 104 triệu đồng) để hỗ trợ Quang có đủ tiền trả lại cho Qualitex. Ngoài ra, Hải còn sử dụng bằng đại học giả.
