Hai bên sẽ thành lập Ủy ban hỗn hợp, Ủy ban về Thương mại hàng hóa, Tiểu ban về Quy tắc xuất xứ để phối hợp triển khai hiệu quả, đồng thời giám sát việc thực thi hiệp định. Theo Ủy ban Kinh tế Á-Âu, việc thành lập khu vực thương mại tự do Việt Nam-EAEU sẽ giúp tăng kim ngạch song phương từ 4 tỷ USD hiện nay lên 8-10 tỷ USD.
Theo hiệp định, EAEU sẽ lập tức loại bỏ thuế quan đối với 6.718 dòng thuế, chiếm khoảng 59% biểu thuế. Nhóm loại bỏ thuế quan theo lộ trình cắt giảm từng năm và sẽ loại bỏ thuế quan ở năm cuối của lộ trình (muộn nhất là đến 2025) gồm 2.876 dòng thuế, chiếm khoảng 25% biểu thuế. Nhóm hạn ngạch thuế quan chỉ bao gồm 2 sản phẩm là gạo và thuốc lá chưa chế biến.