Riêng ông Long còn bị truy tố thêm hành vi “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ”.
Theo cáo trạng, từ tháng 12/2007 đến tháng 5/2008, ông Long đã chỉ đạo ông Hải lập khống hồ sơ, chứng từ thể hiện nội dung Cty Intimex Hà Nội mua của Cty Phú Mỹ Hòa Bình 4.560 tấn tinh bột sắn để xuất khẩu sang Trung Quốc. Việc làm này nhằm hợp thức hóa hành vi chuyển 10,7 tỷ đồng góp vốn vào Cty Phú Mỹ Hòa Bình để kinh doanh sản xuất tinh bột sắn. Tuy nhiên, do biến động thị trường, hàng sản xuất ra không bán được, nên Cty Phú Mỹ Hòa Bình không thể hoàn trả toàn bộ số tiền Intimex đã góp.
Cơ quan chức năng xác định hành vi của các bị can đã vi phạm Luật Doanh nghiệp 2005 và Điều lệ của Cty Intimex. Theo tài liệu điều tra, tính đến tháng 7/2013, Cty Intimex Hà Nội bị thiệt hại hơn 13,4 tỷ đồng cả gốc lẫn lãi phải trả ngân hàng.
Ngoài ra, vẫn theo tài liệu điều tra, trong tháng 1/2008, ông Long còn chỉ đạo nhân viên làm giả các hợp đồng mua, bán cà phê với các doanh nghiệp để tín chấp vay tiền của 3 ngân hàng, chuyển hơn 15 tỷ đồng góp cá nhân với hai người khác kinh doanh bất động sản. Quá trình buôn đất, ông Long không thu hồi được vốn, gây thiệt hại hơn 8,3 tỷ đồng của Cty Intimex.