Theo Sở Tài chính TT-Huế, Trường THPT Cao Thắng để xảy ra 26 khoản sai phạm. Cụ thể, trường tiến hành miễn giảm học phí chưa đảm bảo thủ tục, hồ sơ; chưa viết biên lai đầy đủ theo số phí, lệ phí đã thu; khoản thu, chi giữ xe đạp hạch toán vào thu, chi dịch vụ; thu tiền giữ xe đạp của học sinh cao hơn quy định chung; một số khoản thanh toán còn vượt quy chế chi tiêu nội bộ.
Trường sử dụng nguồn thu dạy thêm, học thêm chưa đúng quy định. Tỷ lệ chi trực tiếp cho giáo viên giảng dạy chỉ ở mức 18,58% so với tổng nguồn thu từ dạy, học thêm. Trường chưa kê khai, thực hiện đầy đủ các nghĩa vụ tài chính như: thuế giá trị gia tăng, thuế thu nhập doanh nghiệp đối với các khoản thu dịch vụ.
Trường cùng Hội cha mẹ học sinh đề ra nhiều loại quỹ, thu nhiều mức khác nhau (riêng năm học 2011-2012 đề ra đến 11 loại quỹ). Nhiều loại quỹ thu vô lý như: quỹ vệ sinh, quỹ cơ sở vật chất, quỹ điện nước, quỹ sửa chữa nhỏ…
Đặc biệt, đối với quỹ khuyến học, trường không chi cho học sinh đạt thành tích cao, mà chi chủ yếu cho khen thưởng giáo viên, ủng hộ các hoạt động của trường.
Cơ quan chức năng xác định, để xảy ra những sai phạm, trách nhiệm chính thuộc về bà Hoàng Thị Mai (Hiệu trưởng) và bà Lê Thị Hồng Khánh (Kế toán trưởng nhà trường).
