Theo người dân, nguyên nhân cá chết nổi dày đặc trên kênh Phú Lộc có thể do Trạm xử lý nước thải Phú Lộc xả nước thải chưa qua xử lý trong khi thời tiết nắng nóng cao điểm, mực nước sông lại hạ thấp, khiến cho không khí càng nặng mùi. Nhiều người dân không chịu được mùi hôi thối, đã chèo ghe vớt cá chết để tiêu hủy, tuy nhiên tình trạng không được cải thiện.
Trước đó, ngày 12 và 13/5, người dân sống ở khu vực này đã chủ động mua vật liệu xây dựng lấp cống xả của Trạm xử lý nước thải ra sông Phú Lộc do không chịu nổi ô nhiễm.
Ngay sau đó, lãnh đạo Công ty Thoát nước và xử lý nước thải Đà Nẵng, Ban Giao thông công chính - Sở GTVT, đơn vị điều hành dự án đã có mặt ở hiện trường, cam kết sẽ tiến hành nâng cấp Trạm xử lý nước thải Phú Lộc bằng việc sử dụng công nghệ hiếu khí SBR để xử lý triệt để mùi hôi trước khi đưa nước thải ra ngoài, dự kiến tháng 4/2016 mới hoàn thành.