Theo kế hoạch kiểm toán 2020, Kiểm toán Nhà nước sẽ thực hiện 146 cuộc kiểm toán. Về kiểm toán chuyên đề, Kiểm toán nhà nước dự kiến lựa chọn kiểm toán một số chuyên đề có quy mô lớn, phạm vi rộng để tổ chức kiểm toán nhằm đánh giá toàn diện, xuyên suốt công tác quản lý, sử dụng tài chính công, tài sản công. Trong đó có việc quản lý và sử dụng vốn trái phiếu Chính phủ tại Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ tài chính, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Bộ Giao thông vân tải.
Trong lĩnh vực đầu tư xây dựng và chương trình dự án, Kiếm toán nhà nước dự kiến thực hiện 34 cuộc kiểm toán dự án đầu tư, trong đó có nhiều dự án lớn, được dư luận quan tâm. Như các dự án BT thuộc Khu đô thị mới Thủ thiêm TP HCM; Đầu tư xây dựng đường vành đai II, III thành phố Hà Nội; các tuyến đường trên tuyến Quốc lộ 1A; tuyến đường bộ cao tốc Bắc - Nam phía Đông giai đoạn 2017-2020…
Liên quan đến lĩnh vực doanh nghiệp và các tổ chức tài chính - ngân hàng, Kiểm toán Nhà nước dự kiến kiểm toán các tổng công ty trực thuộc Tập đoàn Dầu khí, Tổng công ty Điện lực TP.HCM... Nội dung sẽ là kiểm toán báo cáo tài chính, các hoạt động liên quan đến quản lý, sử dụng vốn, tài sản nhà nước năm 2019 kết hợp với việc đánh giá công tác tái cơ cấu doanh nghiệp nhà nước; đánh giá thực trạng công tác quản lý tài chính và cổ phần hóa, thoái vốn đầu tư của Nhà nước.
Về lĩnh vực ngân sách nhà nước, Kiểm toán dự kiến tập trung kiểm toán tổng hợp tại các cơ quan tài chính tổng hợp để đánh giá toàn diện công tác quản lý, điều hành thu, chi ngân sách; xác nhận báo cáo quyết toán ngân sách địa phương; rút ngắn thời gian kiểm toán, giảm tối đa ảnh hưởng của hoạt động kiểm toán tới công tác thường xuyên của đơn vị được kiểm toán.
Trong lĩnh vực ngân hàng, Kiểm toán Nhà nước sẽ tập trung vào các hoạt động liên quan đến quản lý, sử dụng vốn, tài sản nhà nước năm 2018 của Ngân hàng Nhà nước và một số ngân hàng có quy mô lớn như Ngân hàng NN-PTNT; Ngân hàng TMCP Ngoại thương Việt Nam...
