Quy chế làm việc của UBND TP Hà Nội nhiệm kỳ 2016 - 2021 gồm 11 chương, 53 điều, dài 56 trang có hiệu lực sau 10 ngày ký và thay thế Quyết định số 26/2011/QĐ-UBND ngày 29/7/2011 của UBND TP. Theo Quy chế này quy định về nguyên tắc, chế độ trách nhiệm, lề lối làm việc, trình tự giải quyết công việc và quan hệ công tác của UBND TP Hà Nội. Chủ tịch UBND TP, Phó Chủ tịch UBND TP, các Ủy viên UBND TP, người đứng đầu các cơ quan thuộc UBND các quận, huyện, thị xã và tổ chức, cá nhân có quan hệ làm việc với UBND TP chịu sự điều chỉnh của Quy chế này.
Nguyên tắc hoạt động của UBND TP là “làm việc theo chế độ kết hợp trách nhiệm của tập thể UBND TP với việc đề cao trách nhiệm cá nhân của Chủ tịch UBND TP và của mỗi thành viên UBND TP. Mọi hoạt động của UBND TP, thành viên UBND TP phải tuân thủ các quy định của pháp luật và sự lãnh đạo của Thành ủy Hà Nội, giám sát của HĐND TP, bảo đảm tập trung, dân chủ, tuân thủ các quy định của pháp luật và đảm bảo quyền, lợi ích hợp pháp của nhân dân.
UBND TP đề cao trách nhiệm cá nhân, mỗi việc chỉ một người phụ trách và chịu trách nhiệm xuyên suốt. Nếu công việc được giao cho cơ quan thì người đứng đầu cơ quan phải chịu trách nhiệm chính. UBND TP yêu cầu giải quyết công việc đúng phạm vi thẩm quyền và trách nhiệm được phân công, đúng trình tự, thủ tục theo các quy định của pháp luật, chương trình, kế hoạch công tác và Quy chế làm việc của UBND TP; bảo đảm công khai, minh bạch và hiệu quả.
Đặc biệt, mỗi thành viên UBND TP chịu trách nhiệm cá nhân về nhiệm vụ công tác của mình trước UBND TP và cùng với các thành viên khác chịu trách nhiệm tập thể về hoạt động của UBND TP trước Thành ủy, HĐND TP và cơ quan Nhà nước cấp trên.
Cũng theo Quy chế này, Ủy viên UBND TP ở cương vị Chánh Văn phòng UBND TP (hiện nay là ông Phạm Quý Tiên) được UBND TP phân công là người phát ngôn chính thức về các vấn đề liên quan đến thẩm quyền quản lý Nhà nước của UBND TP. Trong trường hợp cụ thể, được sự đồng ý của Chủ tịch UBND TP, Chánh Văn phòng UBND TP có thể phân công cho Phó Chánh Văn phòng UBND TP thực hiện quyền của Người phát ngôn UBND TP về các vấn đề liên quan đến lĩnh vực được phân công phụ trách.