Nhằm tránh những hệ lụy có thể xảy ra trong bối cảnh tình hình COVID-19 đang phức tạp, BTC giải cờ vua trẻ toàn quốc tranh 2020 đã quyết định thay đổi điều lệ chưa từng có trong lịch sử. Theo đó, thay vì kết thúc vào ngày 1/8 như kế hoạch, BTC chuyển 4 ván cuối cờ tiêu chuẩn thành cờ nhanh và tổng kết giải ngay trong tối 29/7.
Cụ thể, ở nội dung cờ tiêu chuẩn (90 phút/kỳ thủ + 30 giây/nước đi), giải đã tiến hành được 5/9 ván đấu. Sau đó, BTC đã quyết định thay đổi điều lệ giải, chuyển 4 ván còn lại từ thể thức tiêu chuẩn sang cờ nhanh (15 phút/kỳ thủ + 10 giây/nước đi).
Cuộc đua ở nội dung cờ tiêu chuẩn diễn ra khá quyết liệt giữa TPHCM và Hà Nội. Kết quả, TPHCM đứng đầu với 12 HCV, 12 HCB, 11 HCĐ; tiếp đó là Hà Nội (10, 6, 11), Ninh Bình (3, 1, 3).
Chung cuộc, với 47 HCV, 38 HCB và 44 HCĐ, TPHCM lần thứ 12 liên tiếp giành ngôi nhất toàn đoàn tại giải. Hà Nội đứng thứ hai với 39 HCV, 28 HCB và 42 HCĐ. Chủ nhà Bà Rịa - Vũng Tàu về thứ ba với 8 HCV, 6 HCB và 9 HCĐ.