Số đơn vị được thanh tra ít hơn so với trước tuy nhiên nội dung thanh tra mở rộng hơn. Trong đó, tập trung vào thanh tra công tác quản lý, sử dụng các khoản thu thỏa thuận đầu năm học, dạy thêm học thêm, mua sắm tài khoản công, sử dụng thiết bị dạy học. Một số Sở GD&ĐT đã thanh tra việc thành lập trường, mở mã ngành, liên kết đào tạo (như phát hiện sai phạm trong liên kết đào tạo ở Trường ĐH Lương Thế Vinh…).
Kết quả làm việc của các đoàn thanh tra đã phát hiện một số trường có khoản thu ngoài quy định, chỉ dựa theo thỏa thuận với cha mẹ học sinh như: mua ghế ngồi sinh hoạt dưới cờ, chụp ảnh thẻ, tiền tân trang các phòng học, bảo trì máy tính, nước uống. Tại Đồng Tháp, chỉ kiểm tra 38 trường học, nhưng phát hiện 13 đơn vị thu trái quy định với số tiền hơn 800 triệu đồng.
