Cụ thể, sau khi hoàn thành việc rà phá bom mìn, từ ngày 24/11/2017, Công ty TNHH một thành viên thoát nước Hà Nội phối hợp cùng các đơn vị liên quan, bắt đầu vào công việc đầu tiên để nạo vét hơn 53.000 m3 bùn trong lòng hồ Hoàn Kiếm. Để thực hiện nạo vét, Công ty đã chia hồ thành 3 vùng thi công trước khi nạo vét, ngăn lưới để đảm bảo, cách ly động vật thủy sinh tại hồ.
Để đảm bảo khối lượng nạo vét khoảng 1000m3/đêm, trong điều kiện chỉ thi công từ 21h00 hôm trước đến 5h00 giờ sáng hôm sau (cuối tuần, thi công từ 0h giờ đến 5h30 sáng hôm sau), Công ty TNHH MTV Thoát nước Hà Nội đã sử dụng thiết bị nạo vét lòng hồ bằng cơ giới, còn trong phạm vi 7m từ chân kè ra nạo vét bằng biện pháp thủ công.
Các phương tiện gồm máy xúc, máy bơm và xe chuyên dụng đảm bảo vệ sinh môi trường. Bùn sau khi nạo vét sẽ được vận chuyển bằng ống đổ thẳng lên các xe ôtô chuyên dụng đỗ ở những vị trí thuận tiện xung quanh đảm bảo không bị rơi vãi ra môi trường xung quanh.
Sau hơn một tháng thi công, đến nay việc nạo vét ở khu vực mặt nước đã hoàn thành khoảng 60% khối lượng.
Theo thông tin từ đơn vị thi công, trong thời gian tới sẽ tiếp tục tập trung tối đa 150 -200 nhân lực phục vụ công tác nạo vét để hoàn thành dự án trước ngày 'ông công ông táo' (23/12 âm lịch tức ngày 8/2/2018 dương lịch) 1 ngày.