Theo đó, CQĐT đề nghị Viện KSND Tối cao truy tố 3 bị can gồm: Lê Tùng Huy (SN 1977, Giám đốc Cty TNHH Thủy sản Vĩnh Nguyên, trụ sở tại quận Bình Thủy, TP Cần Thơ) và Nguyễn Thị Tuyết Trinh (SN 1981, vợ Huy) về tội “lừa đảo chiếm đoạt tài sản”, quy định tại Điều 174 Bộ luật Hình sự. Bị can thứ ba trong vụ án là Đỗ Bảo Phương Quế (SN 1981, cán bộ Phòng khách hàng VCB Chi nhánh Tây Đô) bị đề nghị truy tố về tội danh “ Vi phạm quy định về hoạt động ngân hàng”, theo Điều 206 Bộ luật Hình sự.
Theo kết luận điều tra, mặc dù đang sở hữu Cty Thủy sản Vĩnh Nguyên song do muốn mở rộng sản xuất kinh doanh nên từ năm 2007 đến 2009, Lê Tùng Huy và vợ là Nguyễn Thị Tuyết Trinh đã liên tiếp thành lập thêm 3 công ty khác (Cty TNHH Thủy sản Trường Nguyên, Cty TNHH TMDV Bảo Nguyên và Cty TNHH TMDV Hải Long) để vay vốn VCB Tây Đô.
Đến năm 2011, do cả 4 Cty đều làm ăn thua lỗ, không có tiền trả nợ gốc và lãi đến hạn cho ngân hàng nên Huy đã tìm gặp và đặt vấn đề xin Nguyễn Minh Chuyển, Giám đốc VCB Tây Đô cho khoanh nợ, giãn nợ, bán tài sản đảm bảo để trả nợ nhưng Chuyển không đồng ý.
Thay vào đó, Nguyễn Minh Chuyển gợi ý Huy chuyển nhượng Cty Thủy sản Vĩnh Nguyên cho Nguyễn Hùng Cường (chủ nhóm khách hàng Nam Sông Hậu, em trai Chuyển) để Cường quản lý, điều hành giải quyết nợ cho VCB Tây Đô. Còn Huy sẽ thành lập doanh nghiệp mới và VCB Tây Đô sẽ tạo điều kiện cho các công ty thành lập mới vay vốn để trả nợ gốc, lãi cho 3 Cty còn lại của Huy. Thực hiện phương kế của Chuyển, vợ chồng Huy đã nhờ người thân đứng tên thành lập thêm 3 Cty khác, rồi lập khống hồ sơ năng lực doanh nghiệp, kế hoạch sản xuất kinh doanh, báo cáo tài chính…, để tiếp tục vay vốn VCB Tây Đô.
Mặt khác, tại các cuộc họp giao ban, Nguyễn Minh Chuyển đã chỉ đạo các phòng nghiệp vụ “hỗ trợ” cho Cty của vợ chồng Huy nhằm đảo nợ xấu thành tốt. Thực hiện chỉ đạo của Chuyển, Đỗ Bảo Phương Quế - cán bộ phòng khách hàng đã ký báo cáo thẩm định và đề xuất giới hạn tín dụng cho công ty của vợ chồng Huy mà không tuân theo các quy định về cho vay. Sau đó, Chuyển ký tờ trình gửi Bộ phận quản lý rủi ro Hội sở chính phê duyệt hạn mức tín dụng.
Tính đến tháng 12/2014, 6 Cty của vợ chồng Huy đã phát sinh 8 hợp đồng tín dụng nợ quá hạn, mất khả năng thanh toán với tổng số tiền hơn 421 tỷ đồng. Sau khi thực hiện các biện pháp xử lý tài sản đảm bảo, VCB Tây Đô vẫn thiệt hại hơn 325 tỷ đồng.
Do Nguyễn Minh Chuyển, Giám đốc Chi nhánh và Trần Anh Huy, Trưởng phòng khách hàng VCB Tây Ðô đã bị khởi tố điều tra và xét xử trong vụ án “Vi phạm quy định về cho vay…” xảy ra tại VCB Tây Ðô nên CQÐT không đề nghị xử lý hình sự trong vụ án này.