Theo quyết định, Chủ tịch UBND thành phố Nguyễn Đức Chung là Trưởng Ban chỉ đạo. Phó Chủ tịch UBND thành phố Nguyễn Thế Hùng là Phó Trưởng ban thường trực. Đồng thời mời tham gia Ban Chỉ đạo gồm đại diện Thường trực HĐND thành phố; đại diện Văn phòng Thành ủy. Ngoài ra, Ban Chỉ đạo có thêm 2 Phó trưởng ban gồm Giám đốc Sở Quy hoạch Kiến trúc, Viện trưởng Quy hoạch xây dựng Hà Nội và thành viên đại diện sở, ngành liên quan, Chủ tịch UBND các quận, huyện: Đan Phượng, Bắc Từ Liêm, Tây Hồ, Ba Đình, Hoàn Kiếm, Hai Bà Trưng, Hoàng Mai, Thanh Trì, Thường Tín, Mê Linh, Đông Anh, Long Biên, Gia Lâm.
Ban Chỉ đạo có trách nhiệm chỉ đạo trực tiếp việc tổ chức nghiên cứu lập quy hoạch phân khu đô thị sông Hồng, tỷ lệ 1/5000 (đoạn từ cầu Hồng Hà đến cầu Mễ Sở). Ủy viên Ban Chỉ đạo là Giám đốc các sở, ban, ngành, Thủ trưởng các đơn vị chủ động giải quyết thực hiện nhiệm vụ thuộc trách nhiệm đơn vị mình phụ trách; tham mưu, đề xuất những vấn đề vượt thẩm quyền, báo cáo Trưởng Ban Chỉ đạo, UBND thành phố.
Sở Quy hoạch - Kiến trúc là cơ quan thường trực Ban Chỉ đạo, chịu trách nhiệm chủ trì, đầu mối tổ chức thẩm định và trình Ban Chỉ đạo, UBND thành phố xem xét quyết định; tham mưu các nội đung chuyên môn đối với nhiệm vụ và đồ án quy hoạch.
Viện Quy hoạch xây dựng Hà Nội là đơn vị đầu mối phối hợp, rà soát, hướng dẫn các đơn vị tư vấn nước ngoài hoàn thiện đồ án quy hoạch, báo cáo Sở Quy hoạch Kiến trúc thẩm định, trình cấp có thẩm quyền phê duyệt theo quy định.
