Tại dự án cải tạo BV Đa khoa Xanh - pôn và xây dựng khu nhà điều trị Nội khoa, đoàn thanh tra đã chỉ rõ việc tính toán sai khối lượng; áp định mức đơn giá chưa phù hợp là nguyên nhân làm tăng giá trị gói thầu lên hơn 305 triệu đồng. Bên cạnh đó, công tác nghiệm thu thanh toán công trình này cũng để xảy ra sai sót dẫn đến thanh toán sai tăng gần 235 triệu đồng.
Tương tự, công tác lập, thẩm định, phê duyệt hồ sơ thiết kế bản vẽ thi công và dự toán xây dựng tại dự án đầu tư nâng cấp BV Đức Giang; dự án nâng cấp BV huyện Đông Anh; dự án mở rộng và nâng cấp BV Đa khoa huyện Ba Vì cũng xảy ra việc tính toán sai khối lượng; áp sai đơn giá dẫn đến tăng giá trị gói thầu và cũng đều xảy ra sai sót trong khâu nghiệm thu.
Cụ thể, BV Đức Giang bị tăng giá trị gói thầu gần 2,3 tỷ đồng, nghiệm thu sai tăng hơn 1,3 tỷ đồng; BV huyện Đông Anh bị tăng giá trị gói thầu hơn 1,4 tỷ đồng và nghiệm thu sai tăng gần 600 triệu đồng; BV Đa khoa huyện Ba Vì tăng giá trị gói thầu hơn 1,1 tỷ đồng và nghiệm thu khối lượng sai dẫn đến thanh toán sai hơn 112 triệu đồng.