Ba bị cáo còn lại lĩnh án về tội lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ, gồm: Đỗ Bích Thủy (SN 1962 – nguyên Kế toán trưởng, Phó tổng giám đốc Cty Biển Đông) 3 năm tù treo, Nguyễn Thị Lệ Thủy (SN 1977, ở Hai Bà Trưng, Hà Nội) 24 tháng tù treo, Ngô Văn Nhuận (SN 1970, ở Thanh Xuân, Hà Nội) - nguyên Phó kiểm toán trưởng Kiểm toán Nhà nước khu vực 7 lĩnh 3 năm tù giam.
Theo cáo trạng, cuối năm 2005, ông Bùi Quốc Anh ( khi đó đang là Giám đốc Cty Vận tải Biển Đông) ký hợp đồng với Cty Tài chính công nghiệp tàu thủy - VFC do Hoàng Gia Hiệp (Phó tổng giám đốc) lập báo cáo nghiên cứu khả thi cho dự án mua tàu Energy trị giá hơn 1,5 tỷ đồng. Mua được tàu, ông Hiệp gặp Quốc Anh đề nghị thanh toán và thỏa thuận VFC sẽ trả lại cho Cty Biển Đông 50% số tiền (tương ứng 750 triệu đồng). Để hợp thức hóa số tiền 750 triệu đồng được chuyển lại, Quốc Anh bàn với Hiệp và Đỗ Thị Bích Thủy ký hợp đồng khống với đơn vị thầu phụ để tiền về qua đây, rồi quay lại Cty Biển Đông.
Bà Thuỷ đặt vấn đề với Ngô Văn Nhuận. Ông Nhuận đã tìm đơn vị có tư cách pháp nhân ký hợp đồng nhằm hợp thức hoá hồ sơ, chứng từ thanh toán. Hợp thức được số tiền, ông Nhuận rút hơn 1 tỷ đồng đưa cho bà Bích Thủy, hưởng lợi 33 triệu đồng. Trong khi đó, ông Hiệp được Cty VFC chia 350 triệu đồng rồi chia lại cho các cá
nhân khác.
Sau đó, từ 2006 đến 2008, ông Quốc Anh có các tờ trình, công văn đề nghị Vinashin phê duyệt chủ trương mua tàu chở dầu và tàu vận chuyển container và cho phép Cty Biển Đông được giao dịch, lập báo cáo nghiên cứu khả thi. Đề nghị này của ông Quốc Anh được Vinashin phê duyệt, trong đó báo cáo nghiên cứu khả thi là một phần của dự án mua tàu. Quốc Anh nói với kế toán trưởng tìm đơn vị có tư cách pháp nhân để ký hợp đồng tư vấn, nhằm hợp thức hoá hồ sơ thanh toán, rút tiền để ngoài sổ sách.
Lần này, ông Nhuận tiếp tục đứng ra giúp hoàn thiện hồ sơ khống và đề nghị được trả 40% tổng giá trị hợp đồng. Sau đó Cty Biển Đông đã mua 4 tàu là Victory, Vạn Hưng, Melody, tàu Biển Đông stas. Với việc giúp Cty Biển Đông làm 4 hợp đồng khống, ông Nhuận hưởng lợi hơn một tỷ đồng; gần 2,2 tỷ đồng được đổ về Cty Biển Đông và ông Quốc Anh giao cho thủ quỹ quản lý, sử dụng chi cho quan hệ “đối ngoại”
