Quy trình kiểm định chất lượng giáo dục gồm các bước: Cơ sở giáo dục tiến hành tự đánh giá; Cơ sở giáo dục đăng ký đánh giá ngoài với một tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục và đề nghị xem xét công nhận đạt tiêu chuẩn chất lượng giáo dục; Tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục tiến hành đánh giá ngoài; Tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục thẩm định, công nhận hoặc không công nhận cơ sở giáo dục đạt tiêu chuẩn chất lượng giáo dục.
Cơ sở giáo dục được công nhận đạt tiêu chuẩn chất lượng giáo dục khi đáp ứng những điều kiện: Đã có ít nhất một khóa sinh viên tốt nghiệp; Đã được đánh giá ngoài và có văn bản đề nghị tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục công khai kết quả đánh giá ngoài, xem xét công nhận đạt tiêu chuẩn chất lượng giáo dục. Đối với các cơ sở giáo dục cần được bảo mật thông tin thì không cần đề nghị công khai kết quả đánh giá ngoài;
Kết quả đánh giá ngoài, nội dung nghị quyết và kiến nghị của Hội đồng kiểm định chất lượng giáo dục được công bố công khai trên trang thông tin điện tử của tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục và cơ sở giáo dục ít nhất 30 ngày trước khi được tổ chức kiểm định chất lượng xem xét công nhận.
Đối với các cơ sở giáo dục cần bảo mật thông tin theo quy định của Nhà nước, thì không cần công khai kết quả đánh giá ngoài, nội dung nghị quyết và kiến nghị của Hội đồng; Có ít nhất 80% số tiêu chí đạt yêu cầu theo kết quả đánh giá chất lượng giáo dục của Hội đồng kiểm định chất lượng giáo dục.
Cơ sở giáo dục công bố công khai Giấy chứng nhận kiểm định chất lượng giáo dục trên trang thông tin điện tử của cơ sở giáo dục chậm nhất 30 ngày sau khi được cấp Giấy chứng nhận kiểm định chất lượng giáo dục.
Dự thảo nêu rõ, cơ sở giáo dục đã được cấp Giấy chứng nhận đạt tiêu chuẩn chất lượng giáo dục nhưng sau đó bị phát hiện có những sai phạm, tuỳ theo tính chất và mức độ, sẽ bị cơ quan có thẩm quyền xử lý từ khiển trách, cảnh cáo đến đề nghị tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục thu hồi giấy chứng nhận kiểm định chất lượng giáo dục.