Theo đó, UBND tỉnh Kon Tum giao Giám đốc Sở Nội vụ chủ trì, phối hợp với Giám đốc Sở GD-ĐT kiểm điểm, làm rõ trách nhiệm của ông Lý Thế Quyền-hiệu trưởng Trường Phổ thông Dân tộc nội trú tỉnh Kon Tum trong quá trình quản lý, điều hành; trách nhiệm của các cá nhân liên quan dẫn đến những vi phạm trong thời gian qua; qua đó có hình thức xử lý nghiêm theo quy định của pháp luật, thể hiện đúng tính chất, mức độ vi phạm của hiệu trưởng Trường Phổ thông Dân tộc nội trú tỉnh Kon Tum và các cá nhân có liên quan; có biện pháp chấn chỉnh, củng cố tổ chức, hoạt động của trường trong thời gian tới. Báo cáo kết quả xử lý về UBND tỉnh trước ngày 30-6-2017.
Trước thông tin phản của giáo viên, Sở GD-ĐT Kon Tum đã thành lập đoàn kiểm tra tại Trường Phổ thông Dân tộc nội trú tỉnh Kon Tum tổ chức dạy học phụ đạo, ôn thi tốt nghiệp cho học sinh trong trường. Kết quả cho thấy, tất cả các học sinh đều phải tham gia học và nộp tiền học phụ đạo cho nhà trường.
Thời gian phụ đạo từ tháng 9-2016 đến tháng 4-2017, riêng Khối 12 tổ chức phụ đạo đến tháng 3/2017. Đối với học sinh Khối 10 và Khối 11, trường thu mỗi học sinh 100.000 đồng/tháng.
Mức thu đối với học sinh khối 12 ôn thi tốt nghiệp Trung học Phổ thông là từ 700 - 900 nghìn đồng/học sinh. Số tiền nộp được lấy từ tiền học bổng (920 nghìn đồng/tháng) của các em. Tổng số tiền thu trái quy định là hơn 376 triệu đồng.