GS. Phan Huy Lê sinh ngày 23/2/1934 tại làng Thu Hoạch (nay là xã Thạch Châu, huyện Lộc Hà, tỉnh Hà Tĩnh), trút hơi thở cuối cùng vào 13h10 ngày 23/6/2018 sau nhiều ngày nhập viện, hưởng thọ 85 tuổi.
Đoàn người nối nhau vào viếng GS. Phan Huy Lê Sự ra đi của thầy Phan Huy Lê là tổn thất nặng nề với gia đình, dòng tộc cũng như với ngành sử học nước nhà. PGS.TS. Nguyễn Kim Sơn, Giám đốc Đại học Quốc gia Hà Nội trong phần điếu văn do GS. Nguyễn Quang Ngọc chấp bút đánh giá GS. Phan Huy Lê là nhà khoa học uyên bác với năng suất đáng kinh ngạc 450 cuốn sách, bài báo khoa học.
Nguyên Chủ tịch nước Trương Tấn Sang viếng và chia buồn với tang quyến GS. Phan Huy Lê Cảm tạ tình cảm của lãnh đạo Đảng, Nhà nước, Bộ ban ngành và các đơn vị, họ hàng, bạn bè thân hữu, hàng ngàn học trò đến tiễn đưa GS. Phan Huy Lê, con gái ông nghẹn ngào nhắc về cha mình là người chồng, người cha, người ông mẫu mực. Trong gia đình, GS. Lê luôn là người “giành phần khó về phía mình”, hết mực dành tình cảm tốt đẹp cho người thân.
Phó Thủ tướng Vũ Đức Đam đến viếng GS. Phan Huy Lê và ghi sổ tang 
Hàng ngàn học trò của GS. Lê tới chào tiễn biệt thầy 
Bà Phạm Chi Lan và nhóm chuyên gia tới tiễn biệt GS. Lê-tham gia Hội đồng sang lập và định hướng hoạt động cho Viện 
Nguyên Bí thư Thành ủy Hà Nội Phạm Quang Nghị tới chia buồn với gia đình 
Giám đốc ĐH Quốc gia Hà Nội Nguyễn Kim Sơn điểm lại cả cuộc đời cống hiến cho sự nghiệp làm sử nước nhà của giáo sư Phan Huy Lê. 
Con gái giáo sư Phan Huy Lê sau lời cảm tạ dành những lời thương yêu, kính trọng nhất cho người cha vừa rời xa cõi tạm
Lễ di quan vào hồi 10h40 sáng 27/6. Gia quyến, học trò và họ hàng tiễn đưa GS. Lê tới nơi an nghỉ cuối cùng tại Công viên Nghĩa trang Vĩnh hằng Hà Nội 
