Fakhrizadeh là nhà vật lý hạt nhân hàng đầu của Iran và là "linh hồn" của chương trình hạt nhân Iran, được phương Tây gọi là “cha đẻ của bom hạt nhân Iran trong tương lai”.
Theo báo Anh The Guardian, vào chiều ngày 27/11 giờ địa phương, chiếc xe chở ông Fakhrizadeh đã bị phục kích ở thị trấn Absad, cách thủ đô Tehran khoảng 70 km về phía đông, những kẻ tấn công đã sử dụng chất nổ và súng máy. Các nhân chứng xác nhận có một vụ nổ tại hiện trường và hai bên đọ súng ác liệt. Theo truyền thông Iran, một chiếc xe tải chứa chất nổ đã phát nổ gần chiếc xe mà Fakhrizadeh đang ngồi. Sau khi xe chở ông dừng lại, ít nhất 5 tay súng trang bị súng máy đã bắn vào xe chở ông khiến nó bị thủng nhiều lỗ.
Cùng ngày, Bộ Quốc phòng Iran ra thông báo xác nhận về cái chết của Fakhrizadeh: “Khi đội bảo vệ đọ súng với những kẻ khủng bố, Fakhrizadeh bị thương nặng và được đưa đến bệnh viện. Thật không may, các bác sĩ đã không cứu được ông. Vài phút trước, người phụ trách và nhà khoa học sau nhiều năm nỗ lực cống hiến đã hy sinh cao cả”. Ngoài ra, đội bảo vệ và người thân của ông cũng đều bị thương. Đài truyền hình quốc gia Iran cho biết một trong những kẻ khủng bố tham gia vụ ám sát đã bị bắt.
Hiện tại, chưa có ai đứng ra nhận trách nhiệm về vụ tấn công khủng bố này, nhưng Bộ trưởng Ngoại giao Iran Mohammad Zarif tuyên bố: “Israel có thể đã tham gia vào vụ sát hại nhà khoa học hạt nhân này. Hành vi hèn hạ này thể hiện hành vi hiếu chiến manh động của kẻ chủ mưu. Iran kêu gọi cộng đồng quốc tế, đặc biệt là Liên minh châu Âu, chấm dứt tiêu chuẩn kép đáng xấu hổ và lên án hành động khủng bố của quốc gia này”.
Ông Hossein Dehghan, cố vấn quân sự của lãnh tụ tối cao Iran Khamenei, đã thề trả thù: “Chúng tôi sẽ giáng đòn sấm sét vào thủ phạm đã giết chết liệt sĩ này và khiến chúng phải hối hận về hành động của mình”, Dehan viết tweet. Hãng Reuters đưa tin, đại diện của Iran tại Liên hợp quốc đã gửi thư cho Hội đồng Bảo an và Tổng thư ký Liên hợp quốc Guterres, nêu rõ rằng “có những dấu hiệu quan trọng cho thấy Israel phải chịu trách nhiệm về vụ ám sát này”.
Trước đó, Tổng thư ký Liên Hợp Quốc Guterres lên tiếng thông qua người phát ngôn: “Chúng tôi chú ý đến tin nhà vật lý hạt nhân Iran đã bị ám sát ở ngoại ô Tehran hôm nay. Chúng tôi kêu gọi kiềm chế và tránh mọi hành động nào có thể làm trầm trọng thêm tình hình trong khu vực”.
Sau khi ông Fakhrizadeh chết, Tổng thống Mỹ đương nhiệm Donald Trump đã đăng lại một dòng tweet của Yossi Melman, một phóng viên của báo Israel Haaretz (Tổ quốc) viết: “Theo báo cáo của Iran, Mohsen Fakhrizadeh đã bị ám sát tại Damavand, phía đông Tehran. Ông ta là người đứng đầu dự án quân sự bí mật của Iran và đã bị Mossad (cơ quan tình báo Israel) truy nã trong nhiều năm. Dù là về tâm lý hay nghiệp vụ, cái chết của ông ta đều là đòn giáng mạnh vào Iran”.
Cựu tướng không quân Israel Amos Yadlin nói: “Trong thời gian còn lại của nhiệm kỳ ông Trump, một cuộc tấn công khủng bố như vậy có thể dẫn đến sự trả thù vũ trang từ Iran, nó có thể trở thành cớ để Mỹ tấn công các cơ sở hạt nhân của Iran”.
Theo New York Times, tính đến thời điểm sáng 28/11, có 3 quan chức Mỹ, gồm một quan chức chính phủ và hai quan chức cơ quan tình báo, cho rằng Israel đã lên kế hoạch và thực hiện vụ ám sát ông Fakhrizadeh. Hiện vẫn chưa rõ Mỹ có biết trước về vụ tấn công không, nhưng Mỹ và Israel, với tư cách là đồng minh thân thiết, luôn chia sẻ thông tin tình báo về Iran. Các quan chức Mỹ nói với CNN rằng họ “theo dõi chặt chẽ” những ảnh hưởng sau vụ ám sát, nhưng từ chối phát biểu công khai về vấn đề này để tránh làm leo thang thêm tình hình vốn đã căng thẳng.
Truyền thông Mỹ Axios ngày 25/11 dẫn lời một quan chức cấp cao của Israel cho biết quân đội Israel (IDF) những tuần gần đây đã nhận được chỉ thị chuẩn bị cho một cuộc tấn công quân sự có thể xảy ra của Mỹ nhằm vào Iran trước khi ông Trump rời nhiệm sở. Tin cho biết, chính phủ Israel đã chỉ thị cho IDF chuẩn bị, không phải vì có bất kỳ thông tin tình báo hoặc đánh giá nào rằng ông Trump sẽ ra lệnh tấn công, mà vì các quan chức cấp cao của Israel dự đoán thời gian trước khi ông Biden nhậm chức vào ngày 20/1 sẽ là “thời kỳ rất nhạy cảm”. Các quan chức Israel cho biết IDF đang chuẩn bị cho việc hành động trả thù của Iran có thể xảy ra, Iran có thể trả thù trực tiếp Israel hoặc có thể tiến hành trả thù Israel thông qua các đại diện của họ ở Syria, Dải Gaza và Lebanon.
Theo thống kê của tờ The Guardian của Anh, Fakhrizadeh là người thứ 5 trong dự án vũ khí hạt nhân Iran bị ám sát trong vòng 10 năm qua. Iran đã nhiều lần cáo buộc Israel tham gia vào các vụ ám sát. Phía Israel luôn im lặng trước những cáo buộc này, trong khi Mỹ, quốc gia được Iran gọi là “đồng phạm”, liên tục phủ nhận. Theo The Guardian, các vụ ám sát các nhà khoa học hạt nhân Iran dường như theo một khuôn mẫu cố định, thường là tập kích trên đường đi làm và về nhà.