Theo đó Cơ quan CSĐT đã khởi tố 3 bị can, trong đó có cựu Phó Chánh Văn phòng UBND TPHCM Lê Văn Thanh.
Bị can Nguyễn Thị Thanh An 
Bị can Lê Văn Thanh Đồng thời, Cơ quan CSĐT đã ra Quyết định khởi tố bị can, Lệnh cấm đi khỏi nơi cư trú và Lệnh khám xét chỗ ở và nơi làm việc về hành vi “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí” và “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng” đối với các bị can Nguyễn Thị Thanh An (sinh năm 1967, nguyên Kiểm soát viên SAGRI); Lê Văn Thanh (sinh năm 1962, nguyên Phó Chánh Văn phòng UBND TPHCM); Nguyễn Thanh Chương (sinh năm 1974, nguyên Trưởng phòng Phòng Đô thị thuộc Văn phòng UBND TPHCM).
Bị can Nguyễn Thanh Chương. Trước đó, Văn phòng Cơ quan CSĐT - Bộ Công an đang tiến hành điều tra vụ án “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí” và “Tham ô tài sản” xảy ra tại Tổng Công ty Nông nghiệp Sài Gòn - TNHH Một thành viên; theo Quyết định khởi tố vụ án hình sự số 40/QĐ-C01-P4 ngày 05/7/2019 và Quyết định bổ sung quyết định khởi tố vụ án hình sự số 15/QĐ-C01-P4 ngày 22/8/2019 của Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an.
Quá trình điều tra mở rộng vụ án, ngày 24/02/2021, Cơ quan CSĐT - Bộ Công an đã ban hành các quyết định tố tụng: Quyết định bổ sung quyết định khởi tố vụ án hình sự “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng” xảy ra tại Tổng Công ty Nông nghiệp Sài Gòn - TNHH Một thành viên quy định tại Điều 360 Bộ luật hình sự năm 2015 như trên đối với các bị can trong vụ án này.
