Trụ sở Trung ương Giáo hội và Viện Thần học Phúc Âm được xây dựng tại phường Hòa Xuân, quận Cẩm Lệ, thành phố Đà Nẵng trên tổng diện tích 6.000m2 với tổng kinh phí ước tính 100 tỷ đồng và sẽ hoàn thiện trong vòng từ 3-5 năm.
Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam được chính thức thành lập tại Đà Nẵng ngày 1/9/1956 bởi Mục sư Gordon Smith với sự hỗ trợ từ tổ chức Chiến dịch truyền bá phúc âm toàn cầu (WEC).
Trong thời kỳ 1956-1975, Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam hoạt động chủ yếu ở các tỉnh duyên hải miền Trung và Bắc Tây Nguyên. Tính đến năm 1975, Hội có trên 16.000 tín đồ cả người Kinh và người dân tộc thiểu số Tây Nguyên; có hơn 30 mục sư, truyền đạo, 35 Hội Thánh cơ sở, 20 cơ sở văn hóa xã hội.
Nhân kỷ niệm 50 năm Ngày thành lập Giáo hội Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam (1956-2006), Ban Tôn giáo Chính phủ đã cấp Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động tôn giáo cho Giáo hội.
Sau một năm hoạt động, Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam đã tổ chức Đại hội đồng lần thứ nhất. Trên cơ sở kết quả của Đại hội đồng, Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam đã hoàn chỉnh hồ sơ đề nghị Thủ tướng Chính phủ công nhận về mặt tổ chức theo quy định của pháp luật.
Sau khi xem xét hồ sơ và được sự ủy quyền của Thủ tướng Chính phủ, Ban Tôn giáo Chính phủ đã ra Quyết định số 175 QĐ/TGCP, ngày 22/10/2007 công nhận tổ chức đối với Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam.
Tháng 8/2011, Đại hội đồng Tổng hội lần thứ hai đã bầu Ban Trị sự Tổng hội gồm 11 thành viên do Mục sư Ân Ước làm Hội trưởng. Đến thời điểm hiện nay, Hội Truyền giáo Cơ đốc Việt Nam có hơn 31.000 tín đồ, với 48 mục sư, 168 truyền đạo, 5 nhà thờ, 83 nhà nguyện, 200 điểm nhóm hoạt động ở 14 tỉnh, thành phố trong cả nước.
Phát biểu tại Lễ khởi công, Mục sư Ân Ước - Hội trưởng bày tỏ sự cảm ơn của Giáo hội đối với các ngành chức năng trong suốt thời gian qua đã tạo mọi điều kiện thuận lợi để Giáo hội hoạt động, đặc biệt Ủy ban nhân dân thành phố Đà Nẵng đã cấp đất để hôm nay Giáo hội tổ chức Lễ khởi công công trình mang nhiều ý nghĩa đối với Giáo hội.
Theo TTXVN