Theo nhà trường, 2 ngành này mới được Bộ GD&ĐT cho phép tuyển sinh đào tạo trong năm nay nên không có trong danh mục ngành nghề đào tạo của trường đăng trong cuốn Những điều cần biết về tuyển sinh ĐH, CĐ 2012 do NXB Giáo dục Việt Nam phát hành. Mùa tuyển sinh 2012, trường tuyển 2.800 chỉ tiêu vào 12 ngành ở hệ ĐH và 2.000 chỉ tiêu vào 15 ngành hệ CĐ.
Trường ĐH Cần Thơ nói rằng, trong Những điều cần biết về tuyển sinh ĐH, CĐ 2012 có 2 ngành của trường bị in sai mã ngành. Mã ngành đúng của Ngành kỹ thuật điều khiển và tự động hóa phải là D520216 (thay cho D520116) và mã ngành Công nghệ rau hoa quả và cảnh quan là D620113 (thay cho D620110). Ngoài ra, trường bổ sung tuyển sinh thêm hai ngành: Lâm sinh và kiểm toán.