Báo cáo chính trị tại Đại hội khẳng định: Nhiệm kỳ 2015-2020, Đảng bộ đã lãnh đạo cơ quan hoàn thành toàn diện các mục tiêu, nhiệm vụ do Đại hội đề ra. Tích cực nghiên cứu, tham mưu, đề xuất, hướng dẫn, chỉ đạo và tổ chức thực hiện tốt các mặt hoạt động công tác Đảng, công tác chính trị; những mục tiêu, nhiệm vụ trọng tâm được lãnh đạo, tổ chức chặt chẽ; nền nếp, hiệu lực, chất lượng, hiệu quả hoạt động công tác Đảng, công tác chính trị được nâng lên; góp phần xây dựng Đảng bộ, đơn vị vững mạnh, hoàn thành mọi nhiệm vụ được giao. Tình hình Đảng bộ, cơ quan ổn định, đoàn kết thống nhất và đảm bảo tuyệt đối an toàn.
Trong nhiệm kỳ qua, Phòng Chính trị được Thủ tướng Chính phủ, Bộ trưởng Bộ Quốc phòng, Tổng cục Chính trị QĐND Việt Nam và Ban Quản lý Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh nhiều lần tặng Bằng khen, Cờ thưởng Đơn vị dẫn đầu phong trào thi đua; 8 cá nhân được tặng danh hiệu Chiến sĩ thi đua…
Nhiệm kỳ 2020-2025, Đại hội xác định phương hướng, mục tiêu chung: Quán triệt sâu sắc, vận dụng sáng tạo và tổ chức thực hiện nghiêm túc Nghị quyết Đại hội Đảng toàn quốc lần thứ XIII, Nghị quyết Đại hội Đảng bộ Quân đội lần thứ XI, Nghị quyết Đại hội Đảng bộ Đoàn 969 lần thứ X; nắm vững chủ trương xây dựng đơn vị vững mạnh toàn diện, lấy xây dựng vững mạnh về chính trị làm cơ sở, xây dựng Đảng bộ vững mạnh, tiêu biểu trong Đảng bộ Quân đội.
Tiếp tục đổi mới và nâng cao hiệu lực, chất lượng, hiệu quả hoạt động công tác Đảng, công tác chính trị, xây dựng đội ngũ cán bộ, đảng viên, chiến sĩ có bản lĩnh chính trị vững vàng, tuyệt đối tin tưởng vào sự lãnh đạo của Đảng, trung thành tận tụy với nhiệm vụ gìn giữ lâu dài, bảo vệ tuyệt đối an toàn thi hài Chủ tịch Hồ Chí Minh…
Dự và phát biểu chỉ đạo Đại hội, đại tá Đinh Quốc Hùng, Bí thư Đảng ủy Đoàn 969, Chính ủy Bộ tư lệnh Bảo vệ Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh đã chỉ ra những ưu, khuyết điểm trong nhiệm kỳ qua. Từ đó đề nghị Đảng bộ Phòng Chính trị phát huy truyền thống đoàn kết, gắn bó, chủ động, sáng tạo; mỗi cán bộ, đảng viên cần nêu cao tinh thần trách nhiệm, nỗ lực vươn lên hoàn thành xuất sắc mọi nhiệm vụ, xây dựng Đảng bộ vững mạnh, cơ quan vững mạnh toàn diện, hoàn thành thắng lợi nghị quyết đại hội đề ra.
Một số chỉ tiêu trong nhiệm kỳ 2020-2025 của Đảng bộ Phòng Chính trị Đoàn 969:
100% cán bộ, nhân viên có bản lĩnh chính trị vững vàng, yên tâm công tác, trung thành tuyệt đối với nhiệm vụ gìn giữ lâu dài, bảo vệ tuyệt đối an toàn thi hài Chủ tịch Hồ Chí Minh, sẵn sàng nhận và hoàn thành tốt mọi nhiệm vụ được giao. Tập trung lãnh đạo cơ quan hoàn thành toàn diện, hoàn thành tốt nhiệm vụ chính trị thường xuyên và đột xuất, những nhiệm vụ trọng tâm, hoạt động trọng điểm hoàn thành xuất sắc. Thực hiện tốt nội dung giáo dục chính trị, giáo dục pháp luật và huấn luyện quân sự, kết quả kiểm tra, viết thu hoạch 100% khá, giỏi. Tổ chức tốt phong trào thi đua quyết thắng, thi đua yêu nước. Phấn đấu 100% cán bộ, đảng viên hoàn thành nhiệm vụ, trong đó có từ 85% trở lên hoàn thành tốt nhiệm vụ; tổ chức Đảng 100% được xếp loại “Hoàn thành tốt nhiệm vụ”…