Đường bay Hà Nội - Haneda khai thác với tần suất 7 chuyến/tuần bằng máy bay Airbus A321, khởi hành lúc 8 giờ hằng ngày từ sân bay Nội Bài. Đây là đường bay thứ 9 từ Việt Nam đến Nhật của VNA.
So với sân bay Narita, sân bay quốc tế Haneda cách trung tâm thành phố 14 km phương tiện giao thông công cộng phát triển, nối chuyến nội địa thuận tiện.