Theo Sở y tế, đa số các đơn vị chưa xây dựng phác đồ điều trị, quy trình giám sát chất lượng thuốc tại các khoa lâm sàng, công tác bình bệnh án liên quan đến sử dụng thuốc chưa được quan tâm đúng mức. Tại các khoa lâm sàng thuốc, việc bù thuốc trực chưa kịp thời, danh mục thuốc và thuốc thực tế không khớp với nhau về tên thuốc...
Một số bệnh viện chưa thành lập nhà thuốc bệnh viện, việc liên doanh liên kết với chi nhánh dược đặt quầy thuốc trong khuôn viên của bệnh viện chưa tuân thủ theo các quy định như: quy định về bán lẻ, kiểm tra kiểm soát chất lượng thuốc…