Cụ thể, SDU đã sai phạm khi dự toán tính thêm chi phí vận chuyển lên cao đối với gạch vữa xây, dẫn đến tăng sai số tiền hơn 1,6 tỷ đồng; Lắp đặt ống cấp nước lạnh tính thêm chênh lệch khiến tăng vốn đến hơn 536 triệu đồng. Bên cạnh đó, đoàn thanh tra cũng phát hiện số tiền tạm ứng chưa được quyết toán lên đến hơn 12,9 tỷ đồng.
Thanh tra Bộ Xây dựng yêu cầu SDU giảm trừ dự toán số tiền hơn 2,1 tỷ đồng và tiếp tục nộp về ngân sách nhà nước số tiền nợ thuế của năm 2014 trên 14,3 tỷ đồng.