Hạng mục mới được hoàn thành có lợi trực tiếp cho hành khách đi xe là hệ thống mái che phủ kín các khu vực từ khi vào bến đến lúc ra xe ô tô khách và ngược lại. Hệ thống này vừa hoàn thiện nhưng đã phát huy hiệu quả ngay sau các đợt mưa bão vừa qua. Các khu vực bán vé, nhà chờ, khu vực gửi xe, cây xanh tiểu cảnh … cũng liên tục được chỉnh sửa, nâng cấp. Thậm chí, bến xe vừa trang bị hệ thống xả nước tự động cho nhà vệ sinh bằng động tác mở cửa của hành khách. Sân đón, trả và chờ của xe khách, khu vực dành cho xe buýt, xe taxi, gửi xe máy cũng được tổ chức lại một cách khoa học, tạo sự thông thoáng cho cả trong và ngoài bến.
Với hệ thống mái che vừa được nâng cấp, khách đến bến hầu như không bị ảnh hưởng bởi mưa nắng.
Các điểm chờ xe buýt vẫn còn trống và sẵn sàng mở rộng để đón thêm các xe đến trung chuyển khách.
Các xe khách chạy tuyến Hà Nội - Hải Phòng đã về bến xe Nước Ngầm đón khách.
Bến xe được tổ chức lại một cách khoa học, tạo sự thông thoáng cho cả trong và ngoài bến.