Tỷ lệ bỏ học của ĐBSCL ở cấp tiểu học là 0,45% (cả nước 0,16%), THCS 3,26% (cả nước 1,37%) và cấp THPT 3,94% (cả nước 1,79%).
So với hai vùng miền núi có nhiều khó khăn là Tây Nguyên và Tây Bắc, tỷ lệ học sinh bỏ học ở ĐBSCL vẫn cao hơn nhiều lần.
Khó khăn lớn nhất của ĐBSCL hiện là thiếu trường lớp và phòng học xuống cấp nhiều, hiện toàn vùng còn 1.233 phòng học tạm.