Theo quyết định mới được UBND TP. Hà Nội ban hành, Chi cục Thủy sản Hà Nội sẽ sáp nhập vào Chi cục Chăn nuôi và Thú y Hà Nội và đổi tên thành Chi cục Chăn nuôi, Thủy sản và Thú y Hà Nội (gọi tắt là Chi cục)
Trụ sở chính tại số 114, đường Lê Trọng Tấn (phường La Khê, quận Hà Đông, Hà Nội). Cơ sở 2 tại xã Thanh Liệt (huyện Thanh Trì, Hà Nội).
Chi cục là tổ chức hành chính thuộc Sở NN&PTNT. Chi cục có tư cách pháp nhân, có trụ sở, con dấu riêng, chịu sự chỉ đạo, quản lý của Sở NN&PTNT. Đồng thời, chịu sự hướng dẫn, kiểm tra về chuyên môn, nghiệp vụ của cơ quan chuyên môn có liên quan của Bộ NN&PTNT.
Chi cục có chức năng giúp Giám đốc Sở NN&PTNT tham mưu cho UBND thành phố thực hiện chức năng quản lý nhà nước và tổ chức thực thi pháp luật về chăn nuôi, thủy sản và thú y trên địa bàn.
Về cơ cấu tổ chức, Chi cục có 1 Chi cục trưởng và không quá 2 Phó Chi cục trưởng. Chi cục có 6 phòng chuyên môn, nghiệp vụ và 14 đơn vị trực thuộc.
Năm 2024, Chi cục được giao 110 biên chế công chức, 81 biên chế viên chức hưởng lương từ ngân sách nhà nước, 177 biên chế viên chức hưởng lương từ nguồn thu sự nghiệp của đơn vị, 25 chỉ tiêu lao động hợp đồng.
Theo UBND TP. Hà Nội, trong quá trình thực hiện sắp xếp lại tổ chức, số lượng cấp phó của người đứng đầu các phòng, đơn vị có thể nhiều hơn quy định. Tuy nhiên, khi có cấp phó nghỉ hưu hoặc điều chuyển công tác thì không được bổ sung. Điều này nhằm đảm bảo sau 3 năm kể từ ngày sáp nhập, số lượng cấp phó của người đứng đầu các phòng, đơn vị phải thực hiện theo đúng quy định.