Do nằm ở cuối của nhánh sông Cầu Đá và chưa được cống hóa, nên đoạn chảy qua địa bàn các phường Xuân Đỉnh và Cổ Nhuế 1 luôn bị ô nhiễm nặng do phải hứng chịu phần lớn lượng nước thải dồn ứ. Dòng nước tại đây luôn đục lờ, vương vãi rác thải, bốc mùi xú uế .
Để khắc phục tình trạng ô nhiễm, một số hộ dân sống hai bên sông Cầu Đá luôn phải đóng cửa, thậm chí các khe cửa sổ phải dán chặt băng dính…, nhưng mức độ hạn chế không đáng kể. Chưa biết đến bao giờ dự án cống hóa sông Cầu Đá mới hoàn thành để người dân nơi đây không còn sống chung với ô nhiễm?