Theo Chủ tịch UBND tỉnh Thanh Hóa Nguyễn Đình Xứng, việc bội chi ngoài những nguyên nhân chủ quan do các chính sách mới về BHYT còn có nguyên nhân chủ quan từ các cơ sở khám, chữa bệnh như: Cấp thuốc, chỉ định các xét nghiệm, dịch vụ kỹ thuật không xuất phát từ yêu cầu điều trị bệnh, tăng số ngày nằm điều trị nội trú, thu gom người có thẻ BHYT đi khám chữa bệnh…
Để xảy ra tình trạng trên, trách nhiệm trước hết thuộc về cơ quan Bảo hiểm xã hội (chủ hợp đồng). Việc kiểm tra, giám sát thiếu quyết liệt, chưa hiệu quả; không loại trừ có sự thông đồng giữa các cán bộ bảo hiểm y tế với các cơ sở khám, chữa bệnh để trục lợi BHYT. Một số bệnh viện buông lỏng quản lý, có hiện tượng lạm dụng, thậm chí trục lợi BHYT.