Trước năm học 2010-2011, toàn bộ học sinh ở xa của trường đều phải dựng lều ven trường để theo học.
Sau khi báo chí phản ánh tình trạng vất vả, nguy hiểm của học sinh dựng lều trọ học nơi này, địa phương đã xây dựng 20 phòng để các em vào ở. Mỗi phòng bố trí được 8 học sinh.
Tuy nhiên, hiện nay, do số học sinh xa nhà cần ở lại trọ học còn hơn 120 học sinh, nên nhà trường tạm bố trí, sắp xếp cho các em ở ghép hơn 10 người/phòng hoặc nhiều em phải dậy sớm vượt rừng đến trường và về nhà muộn sau khi tan học... Việc này ảnh hưởng đến việc học tập, sinh hoạt và sức khỏe của các em.
Trong khi đó, nhà ăn và nhà bếp của học sinh chưa có, nên toàn bộ số lều các em dựng trước đây để trọ học được sử dụng làm bếp nấu ăn.
Theo thầy giáo Mai Văn Dũng- Hiệu trưởng trường THCS Mường Lý, hiện toàn trường có 307 học sinh, thì khoảng 270 học sinh ở xa phải trọ học.