Đường hầm metro thứ 2 dài 781m, tương đương với chiều dài đường hầm đầu tiên đã được khoan hoàn thành vào tháng 11/2017 vừa qua. Sau khi khoan xong hầm đầu tiên, robot được tháo rời để di chuyển trở lại ga Ba Son.
Theo đơn vị thi công, đường hầm thứ 2 nằm sâu cách mặt đất 10m, cao hơn đường hầm thứ nhất nên sẽ có ảnh hưởng đến các công trình xung quanh so với đường hầm thứ nhất. Do đó, việc khoan đường hầm thứ 2 sẽ phải rất thận trọng, vừa đào vừa có quan trắc và điều chỉnh cho hợp lý.
Dự kiến đến cuối tháng 6/2018 sẽ hoàn thành khoan đường hầm thứ 2.