Với cương vị người đứng đầu, ông Nguyễn Văn Thanh chịu trách nhiệm chính về những vi phạm, khuyết điểm của Đảng đoàn Liên đoàn Lao động tỉnh, nhiệm kỳ 2013 - 2018.
Ông Nguyễn Văn Thanh đã ký một số văn bản không bảo đảm nguyên tắc tập trung dân chủ, quy chế làm việc và quy định của tổ chức công đoàn; chỉ đạo, tổ chức thực hiện một số nội dung về công tác cán bộ, quản lý tài chính, tài sản và đầu tư xây dựng cơ bản không đúng quy định.
Vi phạm của đồng chí Nguyễn Văn Thanh đã làm ảnh hưởng xấu đến uy tín của tổ chức Đảng, tổ chức công đoàn và cá nhân đồng chí.
Ngoài ra, Ban Thường vụ Tỉnh ủy Hà Tĩnh quyết định thi hành kỷ luật đối với Đảng đoàn Liên đoàn Lao động tỉnh, nhiệm kỳ 2013 - 2018, bằng hình thức khiển trách.
Nguyên nhân là Đảng đoàn Liên đoàn Lao động tỉnh, nhiệm kỳ 2013 - 2018, chậm ban hành quy chế làm việc, thực hiện một số nội dung về công tác cán bộ không đúng quy định, thiếu trách nhiệm lãnh đạo, chỉ đạo, kiểm tra, để một số tập thể, cá nhân vi phạm nguyên tắc tập trung dân chủ, các quy định của Đảng, nhà nước và tổ chức công đoàn trong quản lý tài chính, tài sản và đầu tư xây dựng cơ bản.