Thời gian thi hành kỷ luật ông Bùi Nhật Quang được tính từ thời điểm công bố Quyết định số 643-QĐNS/TW ngày 30/9/2022 của Bộ Chính trị về thi hành kỷ luật đảng.
Trước đó, ông Bùi Nhật Quang bị Bộ Chính trị kỷ luật bằng hình thức cảnh cáo. Tại Hội nghị lần thứ sáu (tháng 10/2022), Trung ương đã thống nhất cho ông Bùi Nhật Quang thôi tham gia Ban Chấp hành Trung ương khóa XIII.
Theo Bộ Chính trị, ông Bùi Nhật Quang chịu trách nhiệm chính, trách nhiệm người đứng đầu về những vi phạm, khuyết điểm của Ban Thường vụ Đảng uỷ Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam nhiệm kỳ 2015 - 2020 (giai đoạn từ tháng 11/2019 đến tháng 8/2020) và nhiệm kỳ 2020 - 2025.
Ông Quang đã vi phạm nguyên tắc tổ chức, sinh hoạt Đảng, Quy chế làm việc của Đảng uỷ dẫn đến nội bộ Ban Thường vụ Đảng uỷ, tập thể lãnh đạo Viện Hàn lâm mất đoàn kết; vi phạm Quy định về những điều đảng viên không được làm, về trách nhiệm nêu gương, về kiểm soát quyền lực trong công tác cán bộ, chống chạy chức, chạy quyền; thiếu trách nhiệm, buông lỏng chỉ đạo, quản lý; thiếu kiểm tra, giám sát để Viện Hàn lâm và một số đơn vị trực thuộc có nhiều vi phạm kéo dài trong công tác cán bộ, quản lý sử dụng tài chính, tài sản, đầu tư công; quản lý nghiên cứu khoa học, đào tạo; giải quyết khiếu nại, tố cáo; không thực hiện nghiêm chỉ đạo, kết luận của các tổ chức đảng cấp trên.
Vi phạm, khuyết điểm của ông Quang gây hậu quả nghiêm trọng, mất đoàn kết nội bộ, bức xúc trong cán bộ, đảng viên, ảnh hưởng xấu đến uy tín của tổ chức đảng, Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam và bản thân.