Tại đại hội, các đại biểu đã thảo luận, nghe ý kiến đóng góp về dự thảo Báo cáo chính trị trình Đại hội; thẳng thắn đánh giá những khuyết điểm, hạn chế nhằm đề ra mục tiêu, phương hướng và nhiệm vụ trong nhiệm kỳ mới. Đại hội đã nhận được nhiều tham luận và đóng góp của các đơn vị, thể hiện sự nhất trí cao về quan điểm, chủ trương, nhiệm vụ xây dựng Đoàn và phong trào thanh thiếu nhi; thống nhất việc tiếp tục đổi mới nội dung và phương thức hoạt động, hướng trọng tâm về cơ sở, mở rộng mặt trận đoàn kết tập hợp thanh niên, tham gia xây dựng Đảng và chính quyền.
Đại hội đã biểu quyết thông qua Nghị quyết Đại hội Đoàn TNCS Hồ Chí Minh tỉnh lần thứ XIII, với 11 tiêu chí: 100% cơ sở Đoàn có giải pháp phù hợp thực hiện tốt việc học tập, quán triệt các nghị quyết của Đảng, của Đoàn, chính sách pháp luật của Nhà nước; có hình thức sáng tạo trong giáo dục truyền thống, đạo đức lối sống, pháp luật cho thanh thiếu nhi. Phấn đấu nhận giúp đỡ, cảm hóa được 600 thanh niên chậm tiến trở nên tiến bộ. Triển khai ít nhất 3.500 công trình, phần việc thanh niên tham gia xây dựng nông thôn mới, đô thị văn minh. Tặng ít nhất 5.000 suất học bổng trị giá 10 tỷ đồng trở lên cho học sinh, sinh viên có hoàn cảnh khó khăn, học giỏi. Tỷ lệ đoàn viên ưu tú được kết nạp vào Đảng đảm bảo đạt 70% trở lên trong tổng số đảng viên mới được kết nạp; 100% cán bộ đoàn chủ chốt các cấp được tập huấn nghiệp vụ, kỹ năng hàng năm…
Đại hội đã tiến hành bầu Đoàn đại biểu đi dự Đại hội Đoàn toàn quốc lần thứ XI, nhiệm kỳ 2017-2022, gồm 12 thành viên. Ra mắt Ban chấp hành khóa mới gồm 45 thành viên, anh Nguyễn Xuân Vĩnh đắc cử Bí thư tỉnh đoàn Bình Định nhiệm kỳ 2017 – 2022.