Theo đó, chi phí khám, điều trị COVID-19 tại các bệnh viện dã chiến, trạm y tế lưu động do ngân sách nhà nước bảo đảm theo chi phí thực tế; chi phí điều trị các bệnh khác trong quá trình điều trị COVID-19 sẽ do quỹ BHYT thanh toán theo quy định và các công văn hướng dẫn số 3100/BYT-BH; 6373/BYT-BH và 9262/BHYT-BH.
Các cơ sở y tế điều trị COVID-19 lập hồ sơ khám chữa bệnh của người có thẻ BHYT gửi bệnh viện được giao phụ trách để thực hiện thanh toán; trạm y tế lưu động lập hồ sơ gửi Trạm Y tế cấp xã trên địa bàn để thanh toán (nếu không có Trạm Y tế cấp xã thì gửi hồ sơ lên cơ sở y tế cấp huyện).