Theo đó, 3 trạm được đề nghị xóa bỏ gồm: trạm thu phí Việt Trì (QL 2) do khoảng cách quá gần (28km) so với trạm thu phí BOT đường tránh Vĩnh Yên (Vĩnh Phúc); trạm thu phí cầu Hồ (QL 38) có số thu quá thấp (số thu năm 2009 là 5 tỷ đồng); trạm thu phí km 58 QL 18 (Quảng Ninh) có khoảng cách quá gần (34km) so với trạm Phả Lại.
Bốn trạm thu phí được đề xuất tạm dừng gồm: trạm thu phí Yên Thành (QL 7) do tuyến đường này đang được đầu tư nâng cấp; trạm thu phí Hồng Lĩnh (QL 8) có số thu dưới 10 tỷ đồng/ năm; trạm thu phí Sóc Sơn (QL3) nằm trên tuyến đường đã bàn giao cho Hà Nội quản lý; trạm thu phí số 3 (QL 14) hiện đang thi công đường Hồ Chí Minh được đề nghị tạm dừng thu trong 1 năm cho đến khi dự án hoàn thành.