Đây là đầu mối trung chuyển hoa quả đi các chợ ở thủ đô và nhiều tỉnh lân cận.
21h hàng đêm, xe tải nối đuôi nhau về xếp dọc ngang từ cửa chợ tới phố Tân Ấp, đường Yên Phụ và tại điểm trung chuyển xe buýt để đổ hàng.
Lúc này, chợ bắt đầu đông đúc cảnh cửu vạn gồng gánh vận chuyển. Thời điểm từ 0h đến 5h sáng là nhộn nhịp nhất.
Lực lượng đông nhất là các chị em hành nghề cửu vạn, bốc vác, gánh thuê. Mỗi một lần vận chuyển từ xe ra vị trí tập kết, một người được hưởng từ 20.000 đồng trở lên.
Mặt hàng tại chợ đầu mối Long Biên rất phong phú với nhiều loại rau, củ, không chỉ có hoa quả.
Do lượng hàng cung cấp ngày một tăng nên chợ đầu mối Long Biên luôn bị quá tải.
Phía ngoài cổng giao thông thường xuyên ùn tắc.
Vào nửa đêm, trong khi cả thành phố đang ngủ say thì nơi đây sáng rực ánh đèn và một bầu không khí làm việc tấp nập.
Theo quy hoạch phát triển mạng lưới chợ đến năm 2025, tầm nhìn đến năm 2035 do Bộ Công Thương ban hành, chợ Long Biên sẽ không còn chức năng là chợ đầu mối và tồn tại với chức năng chợ hạng II theo Quy hoạch của UBND thành phố Hà Nội.