Theo cáo trạng của Viện KSND tối cao, cuối năm 2013, Nguyễn Minh Hùng (SN 1978), Chủ tịch HĐQT kiêm TGĐ Cty CP VN Pharma đã thông qua Võ Mạnh Cường (SN 1978), Giám đốc Cty TNHH Thương mại và hàng hải Quốc tế H&C - đặt mua thuốc tân dược do Cty Helix Pharmaceuticals Inc Canada sản xuất để bán và đấu thầu cung cấp cho các bệnh viện tại Việt Nam. Trong đó, có thuốc H-Capital 500mg Caplet chữa ung thư.
Khi Cty VN Pharma nhập 9.300 hộp thuốc nói trên về kho, Cục Quản lý dược (Bộ Y tế) đã yêu cầu Cty giải trình đồng thời niêm phong lô thuốc không cho bán ra thị trường. Cục Quản lý dược đã đề nghị Cục An ninh chính trị nội bộ xác minh và chuyển hồ sơ, tài liệu liên quan sang Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an.
Kết quả điều tra cho thấy, Nguyễn Minh Hùng thống nhất mua thuốc H-Capital với giá 0,9 USD/viên (tương đương 27 USD/hộp) với Võ Mạnh Cường. Cường liên hệ mua thuốc của một người có tên là Raymundo ở Philippines (hiện không xác định được nhân thân, lai lịch) với giá 0,6 USD/viên (18 USD/hộp).
Raymundo đã gửi Giấy chứng nhận bán hàng tự do (FSC) tại Canada của thuốc H-Capital 500 mg Caplet và Giấy chứng nhận thực hành tốt sản xuất thuốc (GMP) do Bộ Y tế Canada cấp cho Cty Helix Canada về cho Cường, để Cường cung cấp cho VN Pharma. Các giấy này được đóng dấu hợp pháp hóa lãnh sự của Đại sứ quán Việt Nam tại Canada với chữ ký của Tham tán Nguyễn Văn Quyền.
Thế nhưng, qua xác minh, Cục Lãnh sự Bộ Ngoại giao cho biết, Đại sứ quán Việt Nam tại Canada không có Tham tán nào tên Quyền. Kết quả giám định của Viện Khoa học hình sự Bộ Công an kết luận, dấu hợp pháp hóa lãnh sự và chữ ký của Tham tán Đại sứ quán Việt Nam trên các giấy FSC và GMP đều là giấy tờ giả.
Tại phần xét hỏi sáng 29/6, bị cáo Nguyễn Minh Hùng cho rằng mình không biết các giấy tờ trên là giả. Chỉ biết các giấy đó do Võ Mạnh Cường đưa ra để chứng nhận cho lô hàng từ Canada. Bản thân bị cáo cũng không đủ trình độ để thẩm định giấy đó là giả hay thật. Bị cáo Võ Mạnh Cường cũng cho rằng do thiếu hiểu biết, nên đã tin tưởng vào phía đối tác nước ngoài, không biết các chứng từ bị làm giả.
Theo cáo trạng, ông Hùng còn bị truy tố hành vi chỉ đạo cấp dưới thuê dược sĩ Phạm Văn Thông (SN 1954) làm giả Tiêu chuẩn và phương pháp kiểm nghiệm thuốc H-Capital 500 mg Caplet để trình Cục Quản lý dược hòng lấy giấy phép nhập khẩu thuốc.
Hùng sử dụng con dấu bất hợp pháp của Phạm Anh Kiệt (SN 1963, TGĐ Cty TNHH MTV Dược Sài Gòn - Sapharco), chỉ đạo nhân viên làm giả hợp đồng mua bán thuốc với Cty Austin Hồng Kông…
Thỏa thuận với Võ Mạnh Cường nâng khống giá mua thuốc và nhập khẩu trái phép 9.300 hộp thuốc H-Capital 500 mg Caplet không rõ nguồn gốc, kém chất lượng vào Việt Nam để tiêu thụ, với giá trị lô hàng hơn 251 nghìn USD, tương đương hơn 5,3 tỷ đồng.
Viện KSND tối cao đề nghị truy tố Nguyễn Minh Hùng, Võ Mạnh Cường, Nguyễn Trí Nhật (SN 1975, nguyên Phó TGĐ VN Pharma), Ngô Anh Quốc (SN 1984, nguyên Phó TGĐ VN Pharma), Phan Cẩm Loan (SN 1973, nguyên Phó phòng xuất nhập khẩu VN Pharma) và Lê Thị Vũ Phương (SN 1982, nguyên Kế toán trưởng VN Pharma) tội buôn lậu ở khung hình phạt tù từ 12 đến 20 năm hoặc chung thân.
Các bị cáo Phạm Văn Thông, Phạm Anh Kiệt và Bùi Ngọc Duy (SN 1986, nguyên Trưởng phòng nghiên cứu phát triển VN Pharma) bị truy tố tội làm giả con dấu, tài liệu của cơ quan, tổ chức với khung hình phạt tù từ 4 đến 7 năm. Trong phiên xét hỏi chiều cùng ngày, do xét thấy còn nhiều tình tiết chưa được làm rõ, chủ tọa phiên tòa tuyên bố cần bổ sung thêm chứng cứ, tòa hoãn việc xét xử cho đến khi nào có lịch xử mới.