Khi thu gom, vận chuyển hải sản nhiễm độc phải bảo đảm không rơi vãi, rò rỉ. Việc tiêu hủy phải bảo đảm vệ sinh môi trường, có cắm biển báo để người dân không đến gần khu chôn lấp.
Bộ này cũng đề nghị các tỉnh lập kế hoạch cụ thể về việc tiêu hủy hải sản nhiễm độc (nêu thời gian, địa điểm, đơn vị chịu trách nhiệm thu gom, vận chuyển hải sản nhiễm độc đến nơi tiêu hủy), báo cáo kết quả tiêu hủy về Bộ trước ngày 5/12/2016. Kinh phí tiêu hủy hải sản nhiễm độc được sử dụng từ nguồn hỗ trợ của Quỹ Bảo vệ môi trường Việt Nam.