Từ năm 2012, ông Thanh ngoài vợ con đuề huề còn cặp bồ với bà Ng. (trú phường Diên Hồng, TP Pleiku), bất chấp gia đình nhiều lần khuyên can. Sau khi được bà Ng. sinh cho một đứa con trai, ông Thanh thường xuyên vắng nhà, vợ ông đã làm đơn tố cáo lên cơ quan chức năng. Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Gia Lai kết luận việc ông Thanh quan hệ nam nữ bất chính với người phụ nữ khác ngoài vợ là sự thật nên đã cách mọi chức vụ về Đảng đối với ông này. Ly hôn vợ, ông Thanh qua ở hẳn với bà Ng.
Theo giấy tờ, ông Lý Hùng Thanh sinh năm 1961, giữ chức Cục trưởng Cục Thống kê Gia Lai từ tháng 2/2010. Nếu đúng lộ trình thì năm 2021 ông Thanh mới đến tuổi hưu.