Đồng thời, Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh Phú Yên cũng khởi tố hai bị can khác là Bùi Văn Nam, Phó trưởng phòng Cải cách hành chính (Sở Nội vụ Phú Yên) và Nguyễn Minh Phát, Phó Chi cục Chăn nuôi và Thú y (thuộc Sở NN&PTNT Phú Yên) về tội Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ. Riêng ông Nam bị bắt tạm giam 4 tháng. Các quyết định quyết khởi tố và lệnh bắt tạm giam đều được Viện KSND tỉnh phê duyệt theo quy định.
Theo kết quả điều tra ban đầu, với vai trò Phó giám đốc Sở Nội vụ, Phó Chủ tịch Hội đồng thi tuyển công chức, viên chức tỉnh Phú Yên, Trưởng ban ra đề thi tuyển công chức năm 2017-2018, Phạm Văn Dũng đã có hành vi cố ý làm lộ bí mật nhà nước. Hai bị can Bùi Văn Nam, Nguyễn Minh Phát với chức trách ủy viên ban chấm thi đã có hành vi lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Cũng liên quan đến vụ án, trước đó vào ngày 2/8/2019, Công an tỉnh Phú Yên đã khởi tố bị can, bắt tạm giam đối với 3 cán bộ, công chức của Sở Nội vụ Phú Yên, gồm Lê Tuấn (SN 1976) - Trưởng phòng tổ chức, công chức, viên chức; Vũ Thị Thái Hòa (SN 1987) về tội cố ý làm lộ bí mật nhà nước; và Trần Văn Nhiên (SN 1977) Phó trưởng phòng tổ chức, công chức, viên chức Sở Nội vụ về tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ. Đến ngày 17/1/2020, Công an tỉnh Phú Yên ra quyết định khởi tố bổ sung đối với bị can Vũ Thị Thái Hòa về tội lừa đảo chiếm đoạt tài sản, Lê Tuấn về tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Được biết kỳ thi tuyển công chức của tỉnh Phú Yên năm 2017-2018 được tổ chức vào ngày 10 và 11/11/2018 để tuyển chọn 180 công chức vào 24 nhóm ngành thuộc các cơ quan, đơn vị, địa phương của tỉnh Phú Yên. Ngay sau khi kỳ thi được tổ chức đã xảy ra việc tố cáo cán bộ làm lộ đề thi. Ngay sau đó, Cơ quan An ninh điều tra Công an Phú Yên đã vào cuộc.