Thực tế không phải như vậy. Cụ thể là bộ máy kế toán của SCIC. Theo báo cáo của Tổng công ty, từ khi SCIC đi vào hoạt động (1-8-2006) đến tháng 9-2008, đơn vị đã ba lần thay đổi lãnh đạo Ban kế toán, nhiều nhân viên trong ban này cuối năm 2008 mới được tuyển dụng, trình độ chuyên môn nghiệp vụ còn hạn chế và chưa có kinh nghiệm trong công tác tổ chức hoạch toán kế toán.
Kết quả kiểm toán cho thấy, trong một số nghiệp vụ kinh tế phát sinh, cán bộ kế toán của SCIC không nắm bắt kịp thời để xử lý và hạch toán theo quy định, dẫn đến báo cáo tài chính năm 2008 của SCIC có các chỉ tiêu với số tiền lớn phải điều chỉnh sau khi kiểm toán.
Ngoài ra, hạch toán doanh thu cổ tức của SCIC cũng chưa đầy đủ, kịp thời theo chế độ quy định. Nhiều trường hợp đã nhận được thông báo chia cổ tức của các doanh nghiệp nhưng cán bộ kế toán của SCIC chưa hạch toán, dẫn đến phản ánh thiếu doanh thu về cổ tức, thiếu công nợ phải thu và thiếu vốn đầu tư tại doanh nghiệp (trường hợp cổ tức trả bằng cổ phiếu).
SCIC cũng hạch toán thiếu lãi dự thu tiền gửi ngân hàng nguồn Quỹ hỗ trợ sắp xếp doanh nghiệp, số tiền lên tới 838 tỷ đồng. Có trường hợp đã thu lãi tiền gửi ngân hàng nhưng hạch toán vào tài khoản phải trả không đúng quy định, số tiền 167 tỷ đồng.
Mặc dù lãnh đạo và nhân viên tại SCIC hưởng lương cao ngất trời như vậy, nhưng, đến cuối năm 2008, bộ phận kế toán SCIC lại không kê khai đầy đủ các khoản thu nhập của từng người để xác định thuế thu nhập cá nhân phải nộp theo quy định.
Trong năm 2008 cán bộ kế toán mới chỉ tạm hạch toán số tiền thuế phải nộp là 2,4 tỷ đồng. Cuối tháng 3-2009, khi đoàn kiểm toán đề nghị SCIC cung cấp bản kê khai quyết toán thuế thu nhập cá nhân năm 2008 nhưng đơn vị chưa tổng hợp số liệu về thu nhập của từng người để tính thuế. Tháng 5-2009, khi quá thời hạn kê khai quyết toán thuế gần 2 tháng SCIC mới có báo cáo này.
Về thuế thu nhập doanh nghiệp, năm 2008, SCIC có hạch toán riêng thu nhập, chi phí từ hoạt động chuyển nhượng vốn (thoái đầu tư) tại các doanh nghiệp, tuy nhiên SCIC lại không kê khai nộp thuế thu nhập riêng nghiệp vụ này theo quy định.
Đoàn kiểm toán đã xác định SCIC phải nộp thêm số tiền thuế lên tới 23,4 tỷ đồng, trong đó 995 triệu đồng tiền thuế thu nhập cá nhân, 22,5 tỷ đồng thuế thu nhập doanh nghiệp.