Nguyên nhân ban đầu tìm hiểu được là do khi ngủ cháu bị rơi xuống nền nhà đang ngập nước nhưng gia đình không biết. Đến 1 giờ sáng, khi chị Nguyễn Thị Bái bừng tỉnh thì phát hiện xác con nổi lên mặt nước.
Đây là địa phương đang bị ngập úng do trận lũ vừa xảy ra ở vùng phân lũ, chậm lũ của Nho Quan, Gia Viễn (Ninh Bình). Hầu hết các nhà ở đây đều bị nước ngập sâu từ 0,5 mét đến 1,5 mét. Cái chết đau lòng của bé Trần Văn Quân là lời cảnh tình đối với người dân trong vùng lũ.
Theo TTXVN