Tuy nhiên, vẫn còn một số hạn chế nhất định và đến năm 2015, những xã được chỉ đạo điểm trong thực hiện chương trình sẽ gặp khó khăn để hoàn thành đủ 19 tiêu chí của chương trình.
Bên cạnh đó, mục tiêu nâng cao thu nhập và đời sống của người dân trên bình diện rộng vẫn chưa đạt yêu cầu đề ra.