Đây cũng là trường THPT chuyên đầu tiên trên địa bàn thành phố Hà Nội công bố điểm chuẩn.
Theo đó, Điểm chuẩn Chuyên Toán học là 21,5 điểm; Điểm chuẩn Chuyên Tin học là 20,5 điểm; Điểm chuẩn Chuyên Vật lý là 17,5 điểm; Điểm chuẩn Chuyên Hoá học là 18,5 điểm; Điểm chuẩn Chuyên Sinh học là 19,0 điểm.
Điểm trúng tuyển được tính là tổng điểm của môn Toán vòng 1 cộng với điểm của môn chuyên (trong đó, môn Toán vòng 1 phải đạt từ 3,0 điểm trở lên và được nhân hệ số 1, môn chuyên phải đạt từ 4,0 điểm trở lên và được nhân hệ số 2)
Điểm môn Ngữ văn không tính vào điểm trúng tuyển nhưng phải đáp ứng điều kiện đạt từ 3,0 trở lên.
Trường ĐH Khoa học Tự nhiên sẽ gửi Thông báo trúng tuyển cho thí sinh. Thí sinh trúng tuyển nhập học vào ngày 29/6/2018.
Ngoài trường THPT chuyên Khoa học tự nhiên, trên địa bàn thành phố Hà Nội còn có một số trường THPT chuyên khác trực thuộc các trường ĐH cũng tổ chức tuyển sinh vào lớp 10 trước kỳ thi tuyển sinh vào lớp 10 của Sở GD&ĐT Hà Nội là THPT chuyên ngữ, thuộc trường ĐH Sư phạm ngoại ngữ, ĐH Quốc gia Hà Nội, THPT chuyên sư phạm, thuộc trường ĐH Sư phạm Hà Nội. Các trường này cũng dự kiến sẽ thông báo điểm thi và điểm chuẩn trong thời gian tới.
Còn đối với các trường THPT và THPT chuyên thuộc Sở GD&ĐT Hà Nội, Sở dự kiến sẽ công bố điểm thi và điểm chuẩn tuyển sinh vào lớp 10 vào ngày 23/6 tới.